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基因序列

Cell丨谷歌AI co-scientist联合帝国理工揭开谜团：提出并验证细菌基因转移机制假说

Cell丨谷歌AI co-scientist联合帝国理工揭开谜团：提出并验证细菌基因转移机制假说
编辑丨&细菌广泛存在于我们周围的环境中，它们生存与进化的方式和速度经常挑战人类的想象。 即使是现在，有关微生物的各个方面仍存在不少未解之谜。 在细菌的高速进化中，除了基因突变，还有一种更高效的方式：基因水平转移（horizontal gene transfer），让耐药性、毒力等关键特征能在不同细菌之间迅速扩散。
9/17/2025 12:00:00 PM
ScienceAI
ICML 2025 | 质量更高、噪声更低、生物信号更强，东京大学&麦吉尔大学提出空间转录组数据建模新方法SUICA

ICML 2025 | 质量更高、噪声更低、生物信号更强，东京大学&麦吉尔大学提出空间转录组数据建模新方法SUICA
作者 | 论文团队编辑 | ScienceAI空间转录组（Spatial Transcriptomics, ST）数据是在同一张组织切片上同步记录「基因表达量」和「空间坐标」的高维信息矩阵。 近期，东京大学郑银强老师组、麦吉尔大学丁俊老师组共同提出了一种针对空间转录组数据建模的方法 SUICA。 相关成果以《Suica: Learning super-high dimensional sparse implicit neural representations for spatial transcriptomics》为题，入选 ICML 2025。
7/21/2025 11:51:00 AM
ScienceAI
剑桥团队革新RNA速率分析：AI算法突破基因动态追踪

剑桥团队革新RNA速率分析：AI算法突破基因动态追踪
编辑丨&RNA 速率模型利用剪接和未剪接的 RNA 计数中包含的时间信息来推断转录动力学，但现有的速率模型通常依赖于粗略的生物物理简化或数值近似来求解基础常微分方程（ODE）。 英国剑桥大学主导的团队提出了 cell2fate，它允许以完全贝叶斯方式求解生物物理学上更准确的模型。 通过将 RNA 速率解决方案分解为模块，cell2fate 在 RNA 速率和统计降维之间建立了生物物理联系。
3/20/2025 2:12:00 PM
ScienceAI
扩散模型+深度学习双剑合璧，生成式AI破解染色质构象

扩散模型+深度学习双剑合璧，生成式AI破解染色质构象
编辑丨&人体内的每一个细胞都包含相同的基因序列，但每个细胞只表达这些基因的一个方面。 这些细胞特异性基因表达模式确保脑细胞与皮肤细胞不同，部分由染色质的三维结构决定，遗传物质控制着每个基因的可及性。 高通量测序和成像技术的最新进展大大提高了如今研究单个细胞基因组组织的能力。
3/10/2025 12:57:00 PM
ScienceAI
病毒接下来会做什么？AI 正在帮助科学家预测它们的演变

病毒接下来会做什么？AI 正在帮助科学家预测它们的演变
编辑丨toileter目前期望的防范病毒的措施是通过查看病毒的基因序列来预测病毒将如何进化。 距离那种方法还有很长的路要走，但越来越多的研究小组正在使用人工智能 （AI） 来预测 SARS-CoV-2、流感和其他病毒的进化。 病毒（尤其是 SARS-CoV-2 等 RNA 病毒）通过积累新的突变不断进化。
1/13/2025 3:03:00 PM
ScienceAI