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谷歌开源DeepPolisher,基因组组装错误率减半,Jeff Dean:令人振奋!

编辑丨coisini精确的基因组组装(Genome assembly)是生物学研究的基石,但即便是最高质量的组装仍会残留构建技术导致的错误。 人类基因组包含 30 亿个核苷酸,即使微小的错误率也会导致错误总量惊人,进而削弱基因组数据的应用价值。 碱基层面的错误通常需要通过额外的抛光(polishing)步骤来修正 —— 该步骤利用与初版组装比对后的测序读段来识别必要的编辑。
8/7/2025 3:17:00 PM
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Nature丨首个AI生成的基因编辑器,脱靶率更低、免疫更轻,兼容碱基编辑

编辑丨&在当下,基因编辑技术在科研工作中并不少见,不少疾病的药物研发、作物改良,都少不了它的技术支持。 源自微生物的 CRISPR 基因编辑器虽然强大,但在移植到非原生环境后,其「功能权衡」——或者说,在活性、特异性等方面的表现并不尽如人意。 基于这种现状,美国加利福尼亚的 Profluent Bio 工作室借助 AI 的辅助设计,构建了一个包含超过 100 万 CRISPR 操纵子的数据集,并提出了一种由人工智能生成的基因编辑器 OpenCRISPR-1,与碱基编辑兼容。
8/5/2025 2:10:00 PM
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Nature丨从基因组到田间,华中农业大学、中国科学院等提出融合生物技术与AI的育种新范式

编辑丨&农业,生民之本。 当金黄的麦浪与稻田在风中起伏,农业研究者的辛劳不知是否会因此而减轻少许。 部分研究者所采用的传统针对作物改良的方式受限于自然与植株本身的潜力,在当下还无法满足粮食安全的需要。
8/4/2025 10:24:00 AM
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人类增强子突变敏感性图谱首次绘制:AI 与体内实验揭示发育调控密码

编辑丨&ENCODE 计划(Encyclopedia of DNA Elements)中提到,人类基因组中仅 2% 序列编码蛋白质,其余 90% 非编码区的调控功能长期成谜。 了解人类生物学需要的不仅仅是绘制基因图谱,还必须了解基因表达是如何被调节的,以指导身体系统的健康发育、生长和维系。 对于作为远端调控元件的增强子,其突变与先天性心脏病、肢体畸形等发育疾病密切相关。
7/10/2025 3:02:00 PM
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超强DNA大模型「GENERator」问世!解锁生命密码设计新范式

编辑 | ScienceAI在基因组学研究领域,DNA 序列的解码与预测一直是科学家们面临的核心挑战。 随着测序技术的飞速发展,我们能够以前所未有的速度获取海量基因组数据,但如何高效解读这些复杂的遗传信息,仍是一个亟待解决的难题。 近年来,大语言模型(LLMs)在自然语言处理领域的成功,为生物序列分析带来了新的契机。
2/17/2025 10:11:00 AM
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