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提速1400倍，准确标注酶活性位点，浙大、澳门理工多模态深度学习方法，登Nature子刊

提速1400倍，准确标注酶活性位点，浙大、澳门理工多模态深度学习方法，登Nature子刊
编辑 | 萝卜皮注释酶中的活性位点对于药物发现、疾病研究、酶工程和合成生物学等多个领域的发展至关重要。尽管已经开发出许多自动注释算法，但速度和准确性之间的重大权衡限制了它们的大规模实际应用。浙江大学、澳门理工大学等机构的联合研究团队引入了 EasIFA，一种酶活性位点注释算法，它融合了来自蛋白质语言模型和 3D 结构编码器的潜在酶表示，然后使用多模态交叉注意框架将蛋白质水平信息与酶促反应知识对齐。EasIFA 比 BLASTp 速度提升 10 倍，召回率、准确率、f1 分数和 MCC 分别提升 7.57%、13.0
8/30/2024 5:00:00 PM
ScienceAI
Meta 推出“自学评估器”：无需人工注释改善评估，性能超 GPT-4 等常用 AI 大语言模型评审

Meta 推出“自学评估器”：无需人工注释改善评估，性能超 GPT-4 等常用 AI 大语言模型评审
Meta 公司为了缓解自然语言处理（NLP）技术依赖人类注释评估 AI 模型的问题，最新推出了“自学评估器”（Self-Taught Evaluator），利用合成数据训练 AI。NPU 技术挑战NPU 技术的发展，推动大型语言模型（LLMs）高精度地执行复杂的语言相关任务，实现更自然的人机交互。不过当前 NPU 技术面临的一个重要挑战，就是评估模型严重依赖人工注释。人工生成的数据对于训练和验证模型至关重要，但收集这些数据既费钱又费时。而且随着模型的改进，以前收集的注释可能需要更新，从而降低了它们在评估新模型时的效
8/7/2024 3:56:11 PM
故渊
新SOTA，仅几个标记基因即可自动标记，复旦大学开发空间转录组学语义注释贝叶斯框架

新SOTA，仅几个标记基因即可自动标记，复旦大学开发空间转录组学语义注释贝叶斯框架
编辑 | 萝卜皮空间转录组学的出现，彻底改变了组织内基因表达的研究。然而，注释空间点的生物特性仍然是一个挑战。为了解决这个问题，复旦大学的研究人员引入了 Pianno，一个基于标记基因自动进行结构语义注释的贝叶斯框架。Pianno 在精确注释各种空间语义（从不同的解剖结构到复杂的肿瘤微环境）以及估计细胞类型分布（跨各种空间转录组学平台生成的数据）方面的卓越能力。研究人员使用 Pianno 结合聚类方法，揭示了人类新皮质深层 3 中区域和物种特异性的兴奋性神经元亚型，展示了人类新皮质的细胞进化过程。Pianno 作为
5/6/2024 6:53:00 PM
ScienceAI
优于人类专家，GPT-4 准确注释单细胞类型，成本低且稳健

优于人类专家，GPT-4 准确注释单细胞类型，成本低且稳健
编辑 | 萝卜皮GPT-4 是一种专为语音理解和生成而设计的大型语言模型。哥伦比亚大学梅尔曼公共卫生学院（Columbia University Mailman School of Public Health）的 Wenpin Hou 和杜克大学医学院（Duke University School of Medicine）的 Zhicheng Ji 证明，大语言模型 GPT-4 可以在单细胞 RNA 测序分析中使用标记基因信息准确注释细胞类型。「注释单个细胞的细胞类型的过程通常非常耗时，需要人类专家比较跨细胞簇的基
3/28/2024 6:44:00 PM
ScienceAI
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