River
8小时处理300万细胞数据,复旦&上交研发双分支架构模型,登Nature子刊
编辑丨%在组织切片的微观世界里,基因表达的空间分布藏着解开生物奥秘的钥匙 —— 胚胎如何发育出肝脏、癌细胞为何侵袭转移,答案往往藏在基因「在哪里表达」的动态变化中。 但传统空间组学方法只能捕捉单一切片的基因表达量,却无法识别不同条件下基因空间位置变化的关键信号。 (如 Sepal 算法对差异空间表达模式基因的 F1 分数仅 41%)针对这些问题,复旦大学与上海交通大学的团队提出了 River 框架,通过双分支预测架构和事后归因策略,根据基因(或者其他特征)对条件差异的贡献进行排名。
7/10/2025 2:30:00 PM
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