River

8小时处理300万细胞数据，复旦&上交研发双分支架构模型，登Nature子刊

编辑丨%在组织切片的微观世界里，基因表达的空间分布藏着解开生物奥秘的钥匙 —— 胚胎如何发育出肝脏、癌细胞为何侵袭转移，答案往往藏在基因「在哪里表达」的动态变化中。但传统空间组学方法只能捕捉单一切片的基因表达量，却无法识别不同条件下基因空间位置变化的关键信号。（如 Sepal 算法对差异空间表达模式基因的 F1 分数仅 41%）针对这些问题，复旦大学与上海交通大学的团队提出了 River 框架，通过双分支预测架构和事后归因策略，根据基因（或者其他特征）对条件差异的贡献进行排名。

7/10/2025 2:30:00 PM

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