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分子科学

「两全其美」，从头设计分子，深度学习架构S4用于化学语言建模

「两全其美」，从头设计分子，深度学习架构S4用于化学语言建模
编辑 | KX生成式深度学习正在重塑药物设计。化学语言模型 (CLM) 以分子串的形式生成分子，对这一过程尤为重要。近日，来自荷兰埃因霍芬理工大学（Eindhoven University of Technology）的研究人员将一种最新的深度学习架构（S4）引入到从头药物设计中。结构化状态空间序列（Structured State Space Sequence，S4）模型在学习序列的全局属性方面表现卓越，那么 S4 能否推进从头设计的化学语言建模？为了给出答案，研究人员系统地在一系列药物发现任务上对 S4 与最先
8/2/2024 3:20:00 PM
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登Science，药物亲和力＜5纳摩尔，加州大学开发特异性药物结合蛋白的从头计算方法

登Science，药物亲和力＜5纳摩尔，加州大学开发特异性药物结合蛋白的从头计算方法
编辑 | 萝卜皮随着抗癌研究的不断深入，科学家们一直在寻找新的方法来提高治疗效果并减少副作用。小分子结合蛋白的从头设计技术是解决这一问题的关键。然而，高亲和力结合和可调特异性，通常需要在计算设计后进行复杂的筛选和优化，这为研究造成了重大阻碍。加州大学旧金山分校的研究人员开发了一种名为 COMBS 的从头蛋白质设计计算方法，并设计了能与新兴抗癌药物紧密结合的蛋白质。实验验证表明，所设计的蛋白质与药物的亲和力强度达到了小于 5 纳摩尔的水平；X 射线晶体结构证实了所设计蛋白质与药物相互作用的准确性。这表明，科学家可以通
4/15/2024 5:30:00 PM
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