DeepGP
糖蛋白组学新方法,复旦开发基于Transformer和GNN的混合端到端框架,登Nature子刊
编辑 | 萝卜皮蛋白质糖基化是糖基对蛋白质进行的一种翻译后修饰,在细胞的多种生理和病理功能中起着重要作用。糖蛋白质组学是在蛋白质组范围内研究蛋白质糖基化,利用液相色谱与串联质谱 (MS/MS) 联用技术获取糖基化位点、糖基化水平和糖结构的组合信息。然而,由于结构决定离子的出现有限,目前糖蛋白质组学的数据库搜索方法通常难以确定聚糖结构。虽然光谱搜索方法可以利用碎片强度来促进糖肽的结构鉴定,但是光谱库构建的困难阻碍了它们的应用。在最新的研究中,复旦大学的研究人员提出了 DeepGP,一种基于 Transformer 和
8/4/2024 7:57:00 PM
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