AI for Science
上海交通大学医学院人工智能蛋白质设计课题组诚聘助理研究员、博士后、客座学生
课题组长简介张海仓，上海交通大学医学院研究员、实验室PI。 博士毕业于中国科学院计算技术研究所计算机专业，曾先后在字节跳动担任人工智能算法工程师、美国哥伦比亚大学担任博士后科学家、中国科学院计算技术研究所担任任副研究员。 研究方向聚焦人工智能算法及“AI 生命科学”交叉领域，尤其在AI 蛋白质设计 与 AI 药物设计方面有长期积累。
3/4/2025 1:04:00 PM
ScienceAI
耶鲁、剑桥等开发MindLLM，将脑成像直接转换为文本
编辑 | 萝卜皮将功能性磁共振成像 (fMRI) 信号解码为文本一直是神经科学界面临的一项重大挑战，它有望推动脑机接口的发展，并加深对大脑机制的了解。 然而，现有的方法往往存在预测性能不佳、任务种类有限以及跨受试者泛化能力较差等问题。 针对这一问题，耶鲁大学（Yale University）、达特茅斯学院（Dartmouth College）和剑桥大学（University of Cambridge）的研究人员提出了 MindLLM，一种专为主题无关且用途广泛的 fMRI 到文本解码而设计的模型。
3/4/2025 1:01:00 PM
ScienceAI
首个强化生成模型AbNovo实现多目标、多约束抗体从头设计，发表于ICLR 2025
编辑 | ScienceAI近期，上海交通大学医学院张海仓课题组联合中原人工智能产业技术研究院与中国科学院计算技术研究所，提出了一项名为AbNovo 的抗体设计新方法。 该方法基于强化学习与深度扩散模型，能够在多目标、多约束条件下实现抗体从头设计。 该研究以「Multi-objective antibody design with constrained preference optimization」为题发表在国际机器学习顶会ICLR2025上。
3/4/2025 1:00:00 PM
ScienceAI
突破性进展！浙大scNiche框架精准识别细胞生态位，助力精准医疗
编辑 | 2049随着单细胞空间组学技术的快速发展，科研人员可以在单细胞分辨率水平上系统探索组织中细胞状态、功能和相互作用。 然而，如何从这些海量的空间组学数据中精确识别和表征细胞生态位（cell niche）仍是一个重大挑战。 近日，浙江大学药学院团队开发了一个名为 scNiche 的计算框架，可以从单细胞分辨率的空间组学数据中有效识别和表征细胞生态位。
3/3/2025 4:23:00 PM
ScienceAI
人工智能如何改变制药行业，对医学的未来意味着什么？
编辑 | 白菜叶制药行业以严谨的研究、复杂的药物开发流程和尖端技术的使用而闻名，而现在，由于人工智能的出现，该行业正在经历一场变革。 从疾病识别和诊断、药物发现、临床试验优化到提高制造效率等应用，人工智能正在加速该行业的发展。 制药行业拥有大量生物、化学数据和患者数据，因此具有独特的优势，可以充分利用人工智能的潜力。
3/3/2025 12:03:00 PM
ScienceAI
检索了15460项研究，AI与机械流行病学建模相结合：机遇和挑战的范围界定回顾
编辑丨toileter将嵌入机械模型中的先前流行病学知识与 AI 的数据挖掘功能相结合，为流行病学建模提供了变革性的潜力。 虽然 AI 与传统机械方法的融合正在迅速发展，但工作仍然分散。 目前，需要更好地纳入现实的决策考虑，扩大对不同数据集的探索，以及进一步研究生物和社会行为机制。
3/3/2025 12:01:00 PM
ScienceAI
速度提升3200倍，准确率提高40%！深度神经网络+纠错码革新DNA存储技术
编辑 | 2049在全球数据量呈指数级增长的今天，传统存储技术的扩展速度已难以跟上。 脱氧核糖核酸（DNA）分子作为一种信息存储介质，以其卓越的信息密度、增强的数据耐久性和几乎可忽略的维护能耗，正逐渐成为解决存储危机的关键方案。 然而，DNA 存储技术面临可扩展性和准确性之间的权衡困境，成为商业化落地的主要障碍。
3/3/2025 11:59:00 AM
ScienceAI
如何准确观察小胶质细胞在三维脑组织中的动态？DeepCellMap给出答案
编辑 | 2049在人类大脑发育过程中，数万亿神经元与胶质细胞形成复杂网络，而小胶质细胞作为中枢神经系统的免疫哨兵，其空间分布与功能动态直接影响神经回路的形成与重塑。 传统组织学分析方法受限于手动标注的低效性和二维图像的局限性，难以揭示细胞在三维组织中的动态互作规律。 尤其在病理条件下，如母体感染 SARS-CoV-2 引发的胎儿脑出血，小胶质细胞如何响应血管损伤仍需深入解析。
2/28/2025 12:34:00 PM
ScienceAI
每小时处理80,000个蛋白质，大卫·贝克、微软等发布Seq2Symm，实现蛋白质对称性精准预测
编辑 | 2049在生物系统中，蛋白质很少以单体形式发挥功能，它们通常需要组装成更高级的复合物。 这些复合物中，由多个相同蛋白质链通过非共价键相互作用形成的结构被称为同源寡聚体，它们的空间排布形成特定的对称性，这对蛋白质的稳定性、折叠和功能至关重要。 然而，从单条序列精确预测蛋白质可能形成的对称结构一直是一项挑战。
2/28/2025 12:32:00 PM
ScienceAI
AI驱动的模拟科学家，涉及生理学、生物物理学、物理化学和量子力学多个领域，登Nature子刊
编辑 | 萝卜皮大型语言模型（LLM）是一种人工智能系统，以自然语言的形式封装大量知识。 这些系统擅长许多复杂任务，包括创意写作、讲故事、翻译、问答、总结和计算机代码生成。 尽管 LLM 已在自然科学领域得到初步应用，但其推动科学发现的潜力仍未得到充分开发。
2/26/2025 3:53:00 PM
ScienceAI
Transformer革新药物研发：TRACER框架实现反应感知的分子设计与合成优化
编辑 | 2049药物研发周期长、成本高是制药行业面临的重大挑战。 据统计，一个新药从研发到上市平均需要 12 年时间，投入高达 26 亿美元。 为提升研发效率，深度学习在分子生成领域取得了显著进展。
2/26/2025 3:52:00 PM
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速度提高40w倍，牛津新的ML策略计算蛋白的自由能扰动，助力药物发现
编辑 | 白菜叶机器学习为快速准确地预测结合亲和力提供了巨大的希望。 然而，目前的模型缺乏稳健的评估，无法完成（命中到）先导化合物优化中遇到的任务，例如对一系列同类配体的结合亲和力进行排序，从而限制了它们在药物发现中的应用。 牛津大学的研究团队首先提出了一种新的基于注意力的图神经网络模型 AEV-PLIG（原子环境向量-蛋白质配体相互作用图），以解决这些问题。
2/24/2025 3:26:00 PM
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南京理工团队推出基于AI增强热力学建模预测3D场景红外辐射特性的新框架
编辑 | ScienceAI在现代军事科技中，虚拟战场构建技术对武器研发和战术决策具有深远影响。 然而，传统三维红外场景模拟面临计算资源消耗大、动态目标与环境交互建模困难、算法验证不足等挑战。 近期，南京理工大学的研究团队在《International Journal of Heat and Mass Transfer》发表了一项突破性研究《A novel framework for predicting 3D scene infrared radiation characteristics through AI-enhanced thermodynamic modeling》。
2/24/2025 3:26:00 PM
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慢思考助力医学大语言模型突破数据瓶颈：上海交大联合上海AI Lab推出MedS3系统
编辑 | ScienceAIOpenAI o1、DeepSeek R1 等模型成功实现了在数学、编程等领域的智能慢思考推理，通过自我反思和修正实现了运行时的性能外推。 然而，在医疗领域，仍然很少有模型可以实现具有长链慢思考的推理。 目前医疗领域的推理模型大多是通过在医疗考试题上对 OpenAI 系列的模型进行蒸馏，并没有考虑推理过程的可验证性，以及医疗任务的覆盖度。
2/21/2025 4:04:00 PM
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清华大学AIR联合水木分子开源DeepSeek版多模态生物医药大模型BioMedGPT-R1
编辑 | ScienceAI2025 年初，DeepSeek给全球引发了 AI 大模型的新一轮热议。 多家市场咨询公司指出，在 DeepSeek 的影响下，从大模型供应商到基础设施和平台供应商的整个 AI 产业生态都掀起了一波「新浪潮」。 DeepSeek R1 以其强大的推理能力，为各行各业带来了智能化升级新机遇。
2/21/2025 4:03:00 PM
ScienceAI
预测所有物种DNA、RNA、蛋白质的形式和功能，Arc、斯坦福、NVIDIA发布最大AI生物模型Evo2
编辑 | 萝卜皮所有生命都用 DNA 编码信息。 虽然测序、合成和编辑基因组代码的工具已经改变了生物学研究，但智能地编写新的生物系统还需要深入了解基因组编码的巨大复杂性。 科学家们今天发布了他们所称的有史以来最大的生物学人工智能（AI）模型——Evo-2。
2/20/2025 2:57:00 PM
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深势科技张林峰：平台化科研入口雏形初现，玻尔赋能未来教育科研
近日，AI在线旗下ScienceAI以了解深势科技旗下AI加持的先进工具玻尔空间站（Bohrium）为契机，对深势科技创始人兼首席科学家、北京科学智能研究院院长张林峰进行了专访。 作为AI for Science领域的先行探索者，张林峰在采访中与我们深入探讨了AI for Science的内涵与发展趋势，玻尔空间站在教育、科研与产业融合中的角色，以及如何通过技术创新解决传统科研中的痛点。 他还分享了玻尔空间站在未来科研生态中的愿景，以及如何通过平台化的方式推动科研范式的变革。
2/19/2025 3:02:19 PM
ScienceAI
AWS与纪念斯隆凯特琳癌症中心合作加速药物研发
编辑 | ScienceAI纪念斯隆凯特琳癌症中心（Memorial Sloan Kettering Cancer Center）正与 AWS（Amazon Web Services）合作，利用人工智能加速其肿瘤学研究。 2025 年 2 月 17 日，他们在纳什维尔举行的 ViVE 会议上宣布了这一消息。 纪念斯隆凯特琳癌症中心首席战略官 Anaeze Offodile 表示，通过使用人工智能分析大量数据，纪念斯隆凯特琳癌症中心将能够获得可实现更好的癌症治疗和更加个性化护理的见解。
2/19/2025 3:02:19 PM
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